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木霉菌可用于防治黄瓜灰霉病和霜霉病、西瓜立枯病和青枯病等。能消灭耕层病菌及害虫，并改良土壤，破除板结，提高土壤通透性及根系供氧量，可抑制多种植物真菌病，如根腐病、立枯病、猝倒病、枯萎病等土传病害。木霉菌剂还有一定的防治根结线虫的效果。比较***的有哈茨木霉菌、绿色木霉菌等等。
三、病毒类微生物农药
目前发现对昆虫有致病力的病毒有300多种，可使200多种鳞翅目害虫感染带毒，常用的病毒有三种：
1、核形多角体病毒。喷在植物上，被昆虫取食后，经胃液消化，游离出棒状病毒粒子，通过胃(肠)皮细胞进入体腔，在昆虫细胞核内复制增殖，感染病毒的昆虫约10天左右即可死亡。如斜纹夜蛾核型多角体病毒可用于防治十字花科蔬菜等多种作物斜纹夜蛾。
2、质形多角体病毒。喷在植物上，被昆虫食后，在昆虫的细胞质内形成圆形病毒粒子，被感染的昆虫，约10-20天死亡。
3、颗粒病毒。喷在植物上，被昆虫食后，约4-5天死亡。如小菜蛾颗粒体病毒可用于防治十字花科蔬菜小菜蛾。
